Projets de programmation 2025 - 2026 - Master 1

Projet de programmation 2025 - 2026 - Master 1


Titre:

Plateforme de typage pour C. trachomatis



Description :

Contexte

Les infections sexuellement transmissibles (IST) bactériennes représentent un problème de santé publique en raison de leur fréquence, de risques de complications comme les infections génitales hautes ou la syphilis congénitale, de séquelles comme l’infertilité, de risques de transmission du VIH et de l’existence de résistances aux antibiotiques pour plusieurs IST bactériennes. Le Centre National de Référence des Infections Sexuellement Transmissibles (CNR IST) bactériennes regroupe trois laboratoires ayant chacun des expertises complémentaires. L'unité basée sur le site du CHU Bordeaux Pellegrin étudie notamment l’épidémiologie des infections à Chlamydia trachomatis et des mycoplasmes urogénitaux.

Réalisation

Une plateforme web locale est actuellement utilisée au laboratoire pour le typage de C. trachomatis, avec une base de donnée Django. La partie traitement de données est codée en python. Dans le cadre d'une uniformisation des processus bio-informatiques du pôle biologie du CHU, le but de ce projet de programmation serait de transformer cette interface vers un nouveau template, mettre à jour et simplifier la base de données et mettre à jour les scripts d'analyse de données.

Requis technologiques : Python, HTML, Django, JSON, SQLite