Projets de programmation 2025 - 2026 - Master 1
Projet de programmation 2025 - 2026 - Master 1
Titre:
Plateforme de typage pour C. trachomatis
Nom(s) du (des) responsables du projet :
Charlotte Héricé.
Laboratoire, courrier-E :
charlotte.herice@chu-bordeaux.fr
Description :
Contexte
Les infections sexuellement transmissibles (IST) bactériennes
représentent un problème de santé publique en raison de leur
fréquence, de risques de complications comme les infections
génitales hautes ou la syphilis congénitale, de séquelles comme
l’infertilité, de risques de transmission du VIH et de l’existence
de résistances aux antibiotiques pour plusieurs IST bactériennes. Le
Centre National de Référence des Infections Sexuellement
Transmissibles (CNR IST) bactériennes regroupe trois laboratoires
ayant chacun des expertises complémentaires. L'unité basée sur le
site du CHU Bordeaux Pellegrin étudie notamment l’épidémiologie des
infections à Chlamydia trachomatis et des mycoplasmes urogénitaux.
Réalisation
Une plateforme web locale est actuellement utilisée au laboratoire
pour le typage de C. trachomatis, avec une base de donnée Django. La
partie traitement de données est codée en python. Dans le cadre
d'une uniformisation des processus bio-informatiques du pôle
biologie du CHU, le but de ce projet de programmation serait de
transformer cette interface vers un nouveau template, mettre à jour
et simplifier la base de données et mettre à jour les scripts
d'analyse de données.
Requis technologiques : Python, HTML, Django, JSON, SQLite