(remanié suite aux mouvements de grève)
Résumé du contenu (30 heures de TD) | |
Une partie introductive : |
Ballade à travers Perl avec deux exemples bioinformatiques concrets. Expressions régulières : introduction ou/et rappels. |
Puis ensuite : |
Retour en profondeur sur les différentes notions. Traitements d'exemples concrets en TD et en projet. Module BioPerl. |
Evaluation : |
1 mini projet pendant 1 séance. 1 évaluation en temps limité à la fin. |
Les archives : sous linux, désarchiver avec unzip et
rendre les .pl exécutables (chmod +x *.pl)
Semaine | Séance 1 (3h) | Séance 2 (3h) | Séance 3 (3h) |
3 avril (1) |
Jeudi 6 avril Partie 1
Diaporama introduction Ballade à travers Perl Sources : archive / consultation |
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10 avril (2) |
Lundi 10 avril Partie 2 Expressions régulières Analyses simples d'un fichier
Feuille d'exercices : Ps
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Jeudi 13 avril Partie 3 Listes et tableaux
Feuille d'exercices : Ps
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Vendredi 7 avril Partie 4 Tableaux associatifs (ou hachages)
Feuille d'exercices : Ps
(+ début Partie 5 à priori) |
17 avril | Vacances de Pâques | ||
24 avril (3) |
Lundi 24 avril Partie 5 Gestion de fichiers
Feuille d'exercices : Ps
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Jeudi 27 avril Partie 6 Compléments sur l'extraction et
Feuille d'exercices : Ps
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1er mai (4) |
Jeudi 4 mai
Mini Projet
Sujet : Ps
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8 mai (5) |
Jeudi 11 mai Partie 7 Correction Mini Projet Fonctions et arguments
Feuille d'exercices : Ps
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15 mai (6) |
Lundi 15 mai Partie 8 BioPerl (introduction)
Feuille d'exercices : Ps
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Vendredi 19 mai Evaluation
Sujet : Ps
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Perl :
BioPerl : (ensemble de modules Perl spécifiques pour la bioinformatique)